侗族古代文化包括醫(yī)藥在內(nèi)，大部分是掌握在佼解庚佬和佼解賀佬（意為本寨受尊敬的人和本寨的頭領(lǐng)）及沖儺手中。他們有許多侗族古歌和巫祝詞語(yǔ)，其中有些是講述侗族醫(yī)藥的，侗醫(yī)的學(xué)術(shù)思想淵源于巫師及巫醫(yī)歌詞之中。

天、地、氣、水、人五位一體的思想，是侗醫(yī)學(xué)術(shù)思想的核心。侗歌“古悶冬庚系韭梭，得地長(zhǎng)庚系冷垠”，“索冷拱暈庚畏病，庚對(duì)董梭轉(zhuǎn)變冷”，意為“天上生人是股氣，地下養(yǎng)人是水和土”，“氣多氣少人遭病，人死斷氣精化水”。侗醫(yī)和沖儺認(rèn)為，天是看不見(jiàn)頂?shù)凝嬋淮笪?，是股氣，地是有形之物，即土和水；人是氣所生的，由土和水所養(yǎng)。這就是侗家的“天人，’和“地人”之說(shuō)。在《人類起源》侗歌中的四個(gè)“奶奶”以及他們所生的松恩、松桑就是“天人”的代表；，洪水滔天，人煙絕跡；，十二兄妹只好婚配，便是“地人”的化身。人的起源與五位一體的思想，是侗族先民們通過(guò)長(zhǎng)期觀察，對(duì)人的起源與自然界的關(guān)系產(chǎn)生的基本概念。

在生理功能方面，侗歌有“庚寥凡間呃瞑久，全靠枚索和枚冷”，意為“人的生存沒(méi)多久，依靠有氣和有水”，說(shuō)明氣和水在維持人體功能活動(dòng)方面的重要性。在臨床治療上，侗醫(yī)非常重視氣和水的作用，常常使用補(bǔ)氣、補(bǔ)水方法。在用藥上，凡是塊根及甜味藥物，都作補(bǔ)水、補(bǔ)血之用。侗醫(yī)對(duì)血和水的認(rèn)識(shí)是同意詞，血和水在體內(nèi)是同一物，統(tǒng)稱“血水”。

在病理方面，侗歌“索冷拱暈庚畏病，庚對(duì)董梭轉(zhuǎn)變冷”，意為“氣多氣少人生病，人死斷氣精化水”。侗醫(yī)認(rèn)為氣和水兩者失去平衡，人就要生??；氣和水由量變到質(zhì)變，是疾病的病理過(guò)程。

對(duì)致病因素的認(rèn)識(shí)。侗歌“呃僂嘰構(gòu)呃病，佟病都系逗亮，悶敦、漾冷、淋霖、抖侖，優(yōu)喉、瘟、蜥、猛、歷、娘、毒蕾、判妞、斗奈相害庚”，意為“誰(shuí)吃糧會(huì)不生病，生病都是著涼、天熱、濕水、淋雨、受風(fēng)、飽餓、發(fā)瘟、蛇、虎、蟲、草、鬼、山神這些降給人的”。這些認(rèn)識(shí)雖然是從感性的形象思維出發(fā)，但其概念還是明確的。

侗醫(yī)認(rèn)為飲食是維持生命的能量泉源，但是如果飲食過(guò)多，不加以節(jié)制，或者吃的過(guò)少，都將影響身體健康，甚至造成疾病。侗醫(yī)有“犯酒、犯肉、犯谷、犯氣”之說(shuō)：酒性熱除寒，飲用適度可調(diào)人體血脈情志，如果用量過(guò)多可傷神傷志，“心神受擾，百病叢生”；肉類補(bǔ)血補(bǔ)體，食用過(guò)多反而傷血傷水；谷類養(yǎng)萬(wàn)物，亦不可過(guò)飽，過(guò)飽傷身；氣：是生命的根本，不可“犯氣”，不犯氣指兩個(gè)方面：一是平時(shí)要保持“心平氣和”，為人善良，遇事不可性急；二是不可憂郁寡言，傷心傷神?！皻馀c神”是相互聯(lián)結(jié)的，傷一不可。

對(duì)于藥物的性味，侗醫(yī)認(rèn)為“藥苦能退熱，藥澀能止瀉，藥香能清腫止痛，關(guān)節(jié)痛要用藥葉為生”。

侗藥有六性六味理論，給侗醫(yī)臨床用藥提供了理論基礎(chǔ)及用藥依據(jù)。用藥先要掌握六性六味，再根據(jù)疾病的臨床表現(xiàn)確定用藥。如冷病用熱藥，熱病用冷藥，用藥才能對(duì)癥，否則不但治不好病，甚至?xí)霈F(xiàn)不良后果。

六味為酸澀、苦、辣、香、淡、甜。六味是通過(guò)人的味覺(jué)識(shí)別出來(lái)的。

六性為熱、涼、收、散、退、補(bǔ)。六性是通過(guò)臨床用藥逐步體現(xiàn)出來(lái)的，其中有的可能是學(xué)習(xí)中藥的先進(jìn)經(jīng)驗(yàn)而產(chǎn)生的。

六味與六性具有藥物內(nèi)在的對(duì)應(yīng)關(guān)系。味苦，性涼，退熱；味辣，性熱，除寒；味香，性散，消腫止痛；味淡，性退、性平，退水、退氣、止血；味甜，性補(bǔ)，補(bǔ)血、補(bǔ)氣；味酸澀，性收，提升、止瀉。

對(duì)于疾病的命名與分類，侗醫(yī)根據(jù)“五位一體”思想，把疾病分為冷病與熱病兩大類。五位中的天、地、氣、水和人都有冷和熱，人的疾病也不外乎冷病與熱病。

熱?。河置麩裏岵?。包括發(fā)燒、火毒、紅腫、癲狂、蟲、蛇、草所致的熱病，各種外傷，會(huì)“過(guò)人”（傳染）的疾病，以及大部分痧癥等。

冷?。喊ú∪俗杂X(jué)冷感或病程長(zhǎng)，體質(zhì)虛弱或不紅不腫的瘡皰等等。冷病又分水病、氣病、虛弱病。水?。荷眢w任何部位的浮腫，統(tǒng)稱水病，又叫水濕病。氣?。悍彩茄屎聿课坏牟“Y出現(xiàn)喘、出氣（呼吸）不勻，或勞動(dòng)時(shí)感到氣不夠用，以及情緒不好，沉默寡言等稱“氣病”。如果是接觸有毒物質(zhì)，如生漆、糞毒、毒蛇咬傷或誤食有毒菌類等，統(tǒng)稱毒氣病。

冷病與熱病具有較高的臨床實(shí)用價(jià)值。由于病因不同，病人體質(zhì)各異，其發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)歸等都有著不同的規(guī)律，在治療原則上就迥然不同、差異極大。如冷病用熱藥，熱病用冷藥，就不能違反這個(gè)規(guī)律。

侗醫(yī)關(guān)于疾病的命名，除受五位一體的學(xué)術(shù)思想影響，還根據(jù)疾病性質(zhì)、病變部位，沿用取類比象進(jìn)行命名。如男性血尿名婦男擺紅癥；男性淋濁名婦男擺白癥；男性體衰性功能低下；繼發(fā)性性功能不全稱婦男月家??；在病名前冠以“婦”字，說(shuō)明這種病名的產(chǎn)生至遲是在母系時(shí)代。另外，有些病名是以患病部位或相似癥狀采用取類比象命名，如胸以上出血性疾病名曰“嚇謬恰（意為野雞癥，與野雞沿上坡的路行走時(shí)，其紅色羽毛由一點(diǎn)紅一片之意），漢語(yǔ)直譯為上路野雞癥；胸以下的出血性疾病，名曰嚇謬呂（下路野雞癥）；又如獨(dú)累侶類（產(chǎn)科胎兒腳先露，意為猴子癥·猴子下樹）。

侗醫(yī)的病證涉及廣泛，但侗醫(yī)并不分科，而是設(shè)有獨(dú)立的“大證”，在“大證”之下又分若干個(gè)小癥，侗醫(yī)的診療方法也是獨(dú)具特色的。