13世紀(jì)初至16世紀(jì)中葉傳統(tǒng)蒙醫(yī)學(xué)形成時期。

元朝的統(tǒng)一結(jié)束了我國唐末以來的長期割據(jù)狀態(tài)，而且把漠北地區(qū)和內(nèi)地更加緊密地聯(lián)系在一起了。這在客觀上促進(jìn)了中醫(yī)學(xué)與傳統(tǒng)蒙醫(yī)學(xué)的交流和借鑒，同時，為傳統(tǒng)蒙醫(yī)學(xué)的形成和發(fā)展提供了歷史舞臺。此期，傳統(tǒng)蒙醫(yī)學(xué)在飲食療法、急救法、傳染病的預(yù)防與治療、藥物療法及各種外治法(如瑟布斯療法、按摩、針灸、藥浴等)都有了進(jìn)一步的發(fā)展?！坝捎陂L期戰(zhàn)爭，特別是蒙古族崇尚騎射，因金瘡與跌打損傷救助的需要，促進(jìn)了外傷科的發(fā)展?！辈⑶遥陂L期實踐基礎(chǔ)上產(chǎn)生了初步的醫(yī)學(xué)理論。這些理論包括:寒熱理淪；滋補理論；以震治震理論；初步的解剖、藥物及急救知識；初步的哲學(xué)觀作為指導(dǎo)等。

中醫(yī)學(xué)與蒙醫(yī)學(xué)的交流空前活躍。據(jù)《長春真人西游記》記載，成吉思汗仰慕道家養(yǎng)生，特召見中原全真道教領(lǐng)袖長春真人丘處機(jī)。七十余歲高齡的長春真人萬里赴約，花費3年時間長途跋涉，到撒馬爾干(今烏茲別克斯坦境內(nèi))附近會合。兩人當(dāng)面談?wù)摰兰抑B(yǎng)生之法。據(jù)《元史》記載，1226年在蒙古軍中發(fā)生傳染性疾病，精通中原文化的耶律楚材應(yīng)用中藥大黃治療，這是蒙古族使用中藥的較早記載。

在蒙漢民族往來的漫長歷史進(jìn)程中，不少北方民族醫(yī)家致力于學(xué)習(xí)和研究漢醫(yī)，有些漢醫(yī)著作被傳播到蒙古地區(qū)，對傳統(tǒng)蒙醫(yī)學(xué)產(chǎn)生了一定影響?！讹嬌耪贰ⅰ度鹬裉媒?jīng)驗方》、《金蘭循經(jīng)》是這一時期出現(xiàn)的蒙漢醫(yī)學(xué)合璧之杰作。其中相當(dāng)篇幅論述了蒙古族傳統(tǒng)醫(yī)藥及其北方游牧民族醫(yī)藥知識?！讹嬌耪烦蓵?330年，為元代飲膳太醫(yī)忽思慧所著，是我國現(xiàn)存第一部營養(yǎng)學(xué)專著。書中收錄了大量蒙古族傳統(tǒng)飲食，并作了理論闡釋?！督鹛m循經(jīng)》為蒙古族學(xué)者忽泰必烈所著，是一部講授針灸和經(jīng)絡(luò)的著作，為元代醫(yī)學(xué)家滑壽《十四經(jīng)發(fā)揮》的底本，“十四經(jīng)”之名起始于此。高武《針灸聚英》載:“《金蘭循經(jīng)》，元翰林學(xué)士忽泰必烈所著，其子光濟(jì)拴次。大德癸卯(1303)，平江郡巖陵邵文龍為之序。首繪臟腑前后二圖，中述手足三陰，三陽走屬，繼取十四經(jīng)絡(luò)流注，各為注釋，列圖于后，傳于北方。自恒山董氏浸梓吳們，傳者始廣。自滑氏注十四經(jīng)發(fā)揮，而人始嫌其簡略矣。”該書對中醫(yī)針灸學(xué)在蒙古地區(qū)的傳播起到重要作用。《瑞竹堂經(jīng)驗方》為元代蒙古族醫(yī)學(xué)家沙圖穆蘇撰著，成書于1323年。書中所列方劑有明顯的北方游牧民族特色，如治骨傷及風(fēng)寒濕痹的方數(shù)量大，且劑型多為攜帶方便的散、丸、膏、丹，而湯劑則少，用藥多峻利，是“由北人氣稟壯實，與南人異治故也?！?/span>

這個時期，蒙醫(yī)的社會地位也有了明顯的變化。如在元朝以前，成吉思汗規(guī)定的“扎撒黑”（治理法典）中明確規(guī)定“免除醫(yī)生的稅賦”［5］的條目，鼓勵發(fā)展醫(yī)學(xué)。在1206年前后，蒙古軍里有軍醫(yī)，專門負(fù)責(zé)戰(zhàn)傷外科。由此可見，當(dāng)時的蒙醫(yī)隊伍，不但在數(shù)量方面增多了，而且社會地位也提高了。