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藏族人高原適應(yīng)性關(guān)鍵遺傳因素被發(fā)現(xiàn)

來源:健康報發(fā)布時間:2015/6/30
導(dǎo)讀:本報訊 (記者胡德榮)中科院上海生命科學(xué)研究院計算生物學(xué)研究所徐書華研究組科研人員,新近采用一種搜尋人群特異拷貝數(shù)變異的新方法,檢測到一段藏族特異的拷貝數(shù)缺失區(qū)域,并通過群體遺傳學(xué)和生物信息學(xué)分析, ...

  本報訊  (記者胡德榮)中科院上海生命科學(xué)研究院計算生物學(xué)研究所徐書華研究組科研人員,新近采用一種搜尋人群特異拷貝數(shù)變異的新方法,檢測到一段藏族特異的拷貝數(shù)缺失區(qū)域,并通過群體遺傳學(xué)和生物信息學(xué)分析,推測該缺失區(qū)域可能是藏族適應(yīng)高原低氧環(huán)境的關(guān)鍵遺傳因素。該研究論文日前在線發(fā)表于最新一期《美國人類遺傳學(xué)雜志》上。專家認為,該研究有助于解決困擾科學(xué)家多年的高原極端環(huán)境生物學(xué)適應(yīng)機制問題。


  在研究中,徐書華等科研人員采用一種搜尋人群特異拷貝數(shù)變異的新方法,在DNA微陣列芯片的原始熒光信號中,檢測出一段藏族特異性缺失的約3400個核苷酸對的區(qū)域,同時通過多種實驗技術(shù)和生物信息學(xué)分析技術(shù),在2000多個世界范圍的人群樣本中,確認了該段拷貝數(shù)缺失的發(fā)生幾率。


  科研人員發(fā)現(xiàn),該段拷貝數(shù)缺失的頻率在藏族人群中高達90%,其中純合缺失個體的頻率達到50%;而在2000多個其他人群的樣本中,其頻率只有3%,并且未發(fā)現(xiàn)攜帶純合缺失的個體。通過參考現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫和文獻進行功能注釋分析,科研人員發(fā)現(xiàn)該缺失的序列上有組蛋白增強子的記號,并且與之前報道的血紅蛋白濃度相關(guān)聯(lián)的單核苷酸位點具有很強的連鎖效應(yīng)。


  同時,科研人員通過對拷貝數(shù)缺失區(qū)域?qū)嵤╅L程PCR和Sanger測序法,進一步驗證了這一缺失在藏族群體中存在頻率高,并確定了該缺失區(qū)域的斷點在基因組的精確位置。隨后,科研人員還對7個藏族人進行了全基因組深度測序,并未發(fā)現(xiàn)除此之外的其他藏族特異的拷貝數(shù)變異。該研究的一系列發(fā)現(xiàn)和證據(jù),都提示了該拷貝數(shù)缺失在藏族低氧適應(yīng)中可能具有重要功能意義。


  據(jù)悉,參與該研究的單位還有中科院昆明動物所、復(fù)旦大學(xué)、西藏民族學(xué)院、新疆醫(yī)科大學(xué)、馬來西亞UCSI大學(xué)、韓國加圖立大學(xué)等。

 

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